摘要：新疆、甘肅是我國古代絲綢之路的必經之地,同時也是黍稷的主要種植區。研究該地區黍稷種質資源的遺傳多樣性和群體遺傳結構,對于開展黍稷起源進化研究,明確黍稷傳播路徑具有重要的意義。本研究利用103對SSR標記對來自新疆、甘肅的216份黍稷資源進行了遺傳多樣性分析,共檢測到299個等位基因,平均每個位點產生2.9個等位基因,平均Shannon’s指數為0.7360,平均觀測雜合度為0.6298,平均期望雜合度為0.5497,多態性信息含量指數為0.0688~0.7786,均值0.4714,具有中度多態性。216份黍稷資源的近交系數為0.5870,遺傳分化系數為0.0383,遺傳分化程度很小。甘肅資源的等位基因數、Shannon-Weaver多樣性指數、Nei’s期望雜合度和PIC值分別為2.8252、0.7347、0.4501和0.4674,其遺傳參數值均大于新疆資源,表明甘肅種質資源的遺傳多樣性較新疆更豐富?；谶z傳距離的聚類分析將216份黍稷資源分為5個類群,類群Ⅰ~Ⅳ共包含7份黍稷資源,與別的資源遺傳關系較遠;96%的資源集中于類群Ⅴ,在遺傳距離為0.38處,類群Ⅴ又分為4個亞群,亞群A和亞群D主要包含甘肅資源,亞群B和亞群C主要包含新疆資源,表明新疆與甘肅資源有明顯分離和相互滲透現象。聚類分析與群體遺傳結構分析結果相似,均與生態地理分布相關。