摘要:線粒體DNA (mitochondrial DNA, mtDNA)作為核外遺傳物質,承載著重要的遺傳信息,其Dloop區序列能反應出物種的遺傳多樣性。為了對貴州豬(Sus scrofa domesticus)種的遺傳多樣性進行評估,本研究選取了高坡豬、關嶺豬、從江香豬、黔南黑豬、黔北黑豬、柯樂豬、江口蘿卜豬、宗地花豬、白洗豬和糯谷豬共10個貴州省地方豬種與梅山豬、榮昌豬和大白豬3個外地品種作為研究對象,利用PCR擴增技術結合直接測序的方法對mtDNA的D-loop區全序列進行擴增分析。結果顯示,實驗群體的mtDNA Dloop區全序列為1 117~1 148 bp,共12種長度的序列,除了宗地花豬的堿基組成差異較大,其他品種的堿基含量基本無差異,均表現為T的含量最高,C的含量最低,堿基A+T含量明顯高于C+G;在有效測序結果的149條拼接序列中發現66個多態位點,定義了16種單倍型,單倍型多樣性為0.421 5。分析高坡豬群體與其他豬種群體之間遺傳關系,發現其間基因交流較少,基因交流值(Nm)均小于1;高坡豬與宗地花豬之間的遺傳分化指數最高,遺傳分化指數(Fst)值為0.412 78,高坡豬與黔南黑豬和關嶺豬的遺傳分化指數較低,說明三者之間的遺傳關系較近。進行品種間的遺傳多樣性分析時發現,高坡豬與黔北黑豬親緣關系較近,而宗地花豬與其他12個品種的親緣關系都較遠。綜合本研究結果可推測,目前10個貴州地方豬種的遺傳多樣性受到外來品種的影響。本研究為進一步了解貴州豬種起源分化以及遺傳多樣性提供理論支持,并為地方豬種保護提供參考資料。
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