摘要：為了了解海南地方豬TLR4基因的多態性,試驗采用PCR技術對五指山豬、臨高豬和屯昌豬的TLR4基因組序列進行了克隆、測序,應用DNAStar和BioEdit軟件分析其序列,SMART、SOPMA、SWISS-MODEL在線軟件分析TLR4蛋白的結構,并預測二級結構和三級結構。結果表明:獲得的三個品種海南地方豬TLR4基因DNA序列全長均為10 435 bp,其中編碼區長2 526 bp,編碼841個氨基酸。三個品種豬TLR4基因序列種內比對時,五指山豬在種內有1個核苷酸位點存在多態性;屯昌豬在種內有6個核苷酸位點存在多態性,2處位于編碼區;臨高豬在種內有3個核苷酸位點存在多態性,1處位于編碼區。三個品種豬TLR4基因序列種間比對時,有27個核苷酸位點存在多態性,其中2個為錯義突變,導致氨基酸改變。三個品種豬的TLR4基因序列的同源性在99.8%~99.9%之間,高度保守。海南豬TLR4基因在7 209位點的G→T突變和7 781位點的G→A位點突變引起了TLR4蛋白二級結構和三級結構發生改變。說明海南地方豬TLR4基因存在多態性,并且其多態性引起的結構改變可能使TLR4基因功能發生變化。