摘要:生長素輸出載體蛋白PIN-formed(PIN)是一類調控植物生長素極性運輸的重要載體元件,與植物生長發育密切相關。利用生物信息學方法對百脈根(Lotuscorniculatus)PIN基因家族成員(LjPIN)進行篩選、鑒定,并對其結構特征、系統進化、編碼蛋白質性質、順式作用元件組成和表達特性等進行研究,為其功能鑒定及利用奠定基礎。結果表明,百脈根基因組中含有27個LjPIN成員,主要分布在1-5號染色體上;27個LjPIN基因含8個可變剪切位點,編碼35個蛋白質;除了LjPIN4、LjPIN13、LjPIN23基因外,其他LjPIN基因均含有內含子,內含子數和外顯子數均為1~10個;LjPIN與擬南芥AtPIN、大豆GmPIN在進化關系上較接近,與水稻OsPIN較遠;LjPIN蛋白大多為堿性的兩性穩定蛋白質,一般含有5種保守基序,基序數量2~9個;LjPIN基因除了含有順式作用基本元件CAAT-box和TATA-box外,還含有光響應、激素響應及生長發育相關的調控元件;11個LjPIN基因在根、莖、葉、花和不同形成時期種子中呈時空差異表達。
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