摘要:目的探討細胞分裂周期蛋白6(CDC6)基因在肺腺癌組織中的拷貝數變異(CNV)對肺腺癌預后的影響。方法從癌癥基因組圖譜(TCGA)數據庫中獲取肺腺癌患者的轉錄譜(mRNA)數據、CNV數據及臨床資料,使用基因表達譜動態分析(GEPIA)數據庫對CDC6基因在肺腺癌組織中的表達情況,及其與CDC6基因CNV和肺腺癌患者預后的關系進行分析。篩選CDC6基因的共表達基因,并進行基因組百科全書(KEGG)通路分析及基因本體(GO)功能富集分析。結果肺腺癌患者腫瘤組織中CDC6基因CNV與CDC6mRNA的表達量呈正相關(P﹤0.01)。CDC6低表達組肺腺癌患者的生存結局明顯優于CDC6高表達組患者(P﹤0.01)。KEGG通路分析結果顯示:CDC6基因的共表達基因富集在DNA復制、錯配修復、核苷酸切除修復等修復相關通路。GO功能富集分析結果顯示:在生物學過程層面,CDC6基因的共表達基因主要參與了DNA鏈的延伸、核酸切除修復、蛋白質去甲?;?、轉錄偶聯切除修復、WNT信號通路、平面細胞極性通路、核因子-κB誘導激酶(NIK)/核因子-κB(NF-κB)信號通路;在細胞構成層面,CDC6基因的共表達基因參與了T復合物、透明帶受體復合物、驅動蛋白復合體、DNA復制因子C復合物的形成;在分子功能層面,CDC6基因的共表達基因參與四鏈體DNA結合。結論CDC6基因CNV可以對肺腺癌組織中CDC6基因的表達進行調控,CDC6基因及其共表達基因可對肺腺癌的DNA復制、修復過程和腫瘤相關信號通路進行調控并可能以此為基礎影響肺腺癌的發展進程。CDC6基因高表達肺腺癌患者的預后不良,其可能成為預測肺腺癌臨床預后的有效生物標志物。
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